Se encuentra en el extremo meridional de la región, bajo condiciones de tipo mediterráneo en transición con la influencia atlántica. La ZEPA incluye el cañón labrado por el río Ebro sobre la roca caliza y que se desarrolla más ampliamente en la provincia de Burgos; además incorpora los páramos de la Lora y Bricia.
En la vecina provincia de Burgos este cañón ha sido designado ZEPA, por lo que su declaración en Cantabria contribuye a proteger una de las mejores zonas del norte de España para la avifauna rupícola, especialmente para las rapaces como el buitre leonado, el alimoche, el águila real o el águila perdicera.
Esta ZEPA aporta una gran diversidad para Cantabria por albergar especies de la Directiva de filiación mediterránea tales como la terrera común, la calandria, el alcaraván o el escribano hortelano, todos ellos característicos de las parameras y llanos cerealistas.